Ростислав Яхонтов отвечал за ремонт вокзалов и техническую эксплуатацию железных дорог, а также возглавлял комиссию по приемке объектов. В 2019 году в Ельце подписали акт о ремонте местной станции. Сооружению было более 70 лет, ему требовалась реконструкция. Подрядчиком стала нижегородская компания «Строй-индустрия НН». По версии обвинения, летом 2019-го Яхонтов без фактической проверки подписал акты выполнения работ. При этом на одних участках рабочие вообще ничего не сделали, на других ремонт выполнили частично. Подобная история повторилась в Белгороде и Грязях Липецкой области. Подрядчиком в этих городах оказалась всё та же «Строй-индустрия НН».
Это повлекло причинение крупного ущерба РЖД в размере 5 млн 911 тыс. рублей. Также Яхонтов своими действиями причинил ущерб авторитету акционерного общества, контрольный пакет акций которого принадлежит России, так как создал представление о вседозволенности и безнаказанности со стороны руководящего состава.
Сейчас Ярослав Яхонтов находится под подпиской о невыезде. Ему грозит от штрафа в 120 тыс. рублей до трех месяцев ареста.